Где в японии дешевле жить?

Дороже всего - в крупных городах, и это не зависит от типа гостиницы. Есть гостиницы в японском стиле - реканы, которые имеют 5 полноценных звезд и стоят как полноценные пять звезд. К таким гостиницам особенный интерес в Киото, Хаконэ, в Наре. Но они есть везде, в том числе, в Токио и Осаке. Гостиницы европейского типа тоже разные - есть сеть Hayatt, супердорогих и суперкомфортных, и сеть гостиниц JR, она бюджетная, но гостиницы расположены очень удобно, они чистые, ухоженные.

В целом - чем ближе к центрам, тем дороже будет любая категория.