Делаю визу в Японию. подскажите пожалуйста, если у меня рабочая виза в Китае , могу ли я сделать визу в Китае ?

Да, если у вас есть residence permit (ваше внж, которое получили после въезда по рабочей визе), то это основание для подачи в Китае. Но в каждой провинции свои правила, так что обращаться нужно в консульский отдел Японии, который обслуживает провинцию вашего официального проживания в КНР, надо гуглить.